Бен ван Беркель получил архитектурное образование в академии Ритвельда в Амстердаме и в Ассоциации архитекторов в Лондоне, которую окончил с отличием в 1987 году.
В 1988 году он вместе с Каролиной Бос основал в Амстердаме архитектурное бюро UNStudio. Сейчас бюро работает над несколькими проектами, в том числе над смешанной застройкой района Саутбэнк в Мельбурне, над масштабным проектом смешанной застройки Four во Франкфурте и над небоскребом Wasl Tower в Дубае.
Вместе с UNStudio Бен ван Беркель реализовал ряд известных проектов, в том числе здание музея Mercedes-Benz в Штутгарте, центральный железнодорожный вокзал Арнема в Нидерландах, смешанную застройку квартала Raffles City в Ханчжоу, башню Canaletto в Лондоне, частную виллу на севере штата Нью-Йорк и здание Университета технологий и дизайна в Сингапуре.
В 2018 году Бен ван Беркель основал архитектурно-технологическую компанию UNSense, которая разрабатывает и внедряет антропоцентричные технические решения для городской среды.
Бен ван Беркель преподавал и читал лекции во многих архитектурных учебных заведениях по всему миру. В 2011–2018 гг. он занимал должность гостя-профессора имени Кэндзо Тангэ в Высшей школе дизайна Гарвардского университета, где вел семинар, посвященный архитектуре и здоровью. В 2017 году Бен ван Беркель выступал на конференции TEDx с презентацией об архитектуре и здоровье. Бен ван Беркель также является членом рабочей группы/экспертного совета по строительству при Министерстве экономики Нидерландов.